Le Ministère, a pour mission d'élaborer et d'appliquer la politique du Gouvernement Gabonais en matière des eaux, des forêts, de la mer, de l’environnement et de la faune et des aires protégées.
A ce titre, il est notamment chargé : (i) d'élaborer et conduire la mise en œuvre de la politique des forêts, de faire entre autres : l'inventaire continu et l'aménagement des ressources forestières ; de protéger et restaurer les écosystèmes forestiers et d'en conserver la biodiversité ; de valoriser les ressources et les écosystèmes forestiers ; d'assurer la régularité et la durabilité de la production des ressources forestières ; de promouvoir l'industrialisation et la commercialisation des produits forestiers ; de concilier les impératifs de développement avec la préservation des ressources forestières ; (ii) d'élaborer et conduire la mise en œuvre de la politique en matière de faune et des aires protégées ; de faire l'inventaire continu et l'aménagement des ressources fauniques et des aires protégées ; de concilier les impératifs de développement avec la préservation de la faune et des aires protégées ; (iii) de développer la coopération et les partenariats aux niveaux sous-régional et international ; (iv) d'informer et sensibiliser le public en matière d’exploitation des ressources forestières, de faune et des aires protégées. Dans cette mission, il bénéficie de l’appui des activités mises en œuvre dans le cadre du collectif DYNAFAC.